lunes, 27 de febrero de 2012

TRANSPOSICION


          SEP                                    SNEST                                  DGEST

“INSTITUTO TECNOLOGICO
DE CIUDAD ALTAMIRANO”

 

PRESENTA: MARTIN HERRERA JUAREZ

UNIDAD: “3”

TRABAJO: “TRANSPOSICION”

No DE CONTROL: 09930312

CARRERA: LIC. EN BIOLOGIA

VI SEMESTRE



Ciudad Altamirano gro. México a 27 de febrero del 2012


TRANSPOSICION

Un transposón o elemento genético transponible es una secuencia de ADN que puede moverse de manera autosuficiente a diferentes partes del genoma de una célula, un fenómeno conocido como transposición. En este proceso, se pueden causar mutaciones y cambio en la cantidad de ADN del genoma. Anteriormente fueron conocidos como "genes saltarines" y son ejemplos de elementos genéticos móviles.


El transposón modifica el ADN de sus inmediaciones, ya sea arrastrando un gen codificador de un cromosoma a otro, rompiéndolo por la mitad o haciendo que desaparezca del todo. En algunas especies, la mayor parte del ADN basura (hasta un 50% del total del genoma) corresponde a transposones. A diferencia de los provirus, los transposones se integran en el ADN celular en lugares bien determinados.

Su existencia fue propuesta por Barbara McClintock en el maíz, sin embargo, su existencia no se demostró hasta mucho más tarde en bacterias. Por ello fue laureada con el Premio Nobel en 1983.
Clasificación
Existe una amplia diversidad de elementos genéticos móviles y pueden ser clasificados en:
v  base a su contenido
v  su estrategia y
v  mecanismo de transposición.

Según contenido

  • Transposón simple, secuencia de inserción o elemento de inserción (IS): contienen una secuencia central con información para la transposasa, una enzima necesaria para la transposición, y en los extremos una secuencia repetida en orden inverso. Cuando un transposón simple se integra en un determinado punto del ADN aparece una repetición directa de la secuencia diana (5-12 pb).
  • Transposón compuesto (Tn): contienen un elemento de inserción (IS) en cada extremo en orden directo o inverso y una región central con la transposasa que además suele contener información de otro tipo. Por ejemplo, los factores de transferencia de resistencia (RTF), poseen información en la zona central para resistencia a antibióticos como el cloranfenicol, la kanamicina, la tetraciclina, dándole una ventaja selectiva a las bacterias que lo posea.

 

 

Según estrategia de transposición

  • Clase I o retrotransposones: se mueven en el genoma siendo transcritos a ARN y después en ADN por retrotranscriptasa. A su vez, se clasifican en los de origen retroviral (retrotransposones con LTR) y de origen no retroviral (retrotransposones sin LTR).
  • Clase II o DNA transposones: se mueven directamente de una posición a otra en el genoma usando una transcriptasa para copiar y pegarse en otro locus del mismo.
  • Clase III o MITE, por sus siglas en inglés "Miniature Inverted-repeats Transposable Elements".

Según mecanismo de transposición

  • Transposición conservativa: el transposón sale de la sede donadora que queda vacía y se incorpora en una nueva sede (sede receptora). No aumenta el número de copias del transposón en el interior de la célula.


    Transposición no conservativa: en este caso la transposasa realiza un corte cohesivo no solo en la secuencia diana, sino también en el genoma donante, dejando un corte a cada lado del transposón. A continuación integra todo el genoma donante con el aceptor, mediante un curioso mecanismo que forma un intermediario llamado “estructura entrecruzada”.

 BIBLIOGRAFIAS







domingo, 26 de febrero de 2012

UNIDAD "3"

                               
                SEP                            SNEST                              DGEST
INSTITUTO TECNOLOGICO DE CIUDAD ALTAMIRANO

PRESENTA: MARTIN HERRERA JUAREZ
UNIDAD: “3”
“ORGANIZACIÓN DEL MATERIAL GENETICO”
No DE CONTROL: 09930312
CARRERA: LIC. EN BIOLOGIA
VI SEMESTRE

Ciudad Altamirano gro. México a 26 de febrero del 2012
TEMARIO
3
Organización del material genético

3.1 Organismos procarióticos:
3.1.1 ADN circular
3.1.2 Proteínas asociadas
3.1.3 ADN extracromosómico.
3.1.3.1 Plásmidos.
3.1.3.2 Bacteriófagos.
3.1.3.3 Transposones
3.2 Organismos eucarióticos:
3.2.1 ADN lineal y empaquetamiento
3.2.1.1 Histonas
3.2.1.2 Solenoides
3.2.1.3 Cromosomas
3.2.2 Complejidad del genoma
3.2.3 ADN mitocondrial.
3.3 Organización genómica viral.

INTRODUCCION

ORGANIZACIÓN DEL MATERIAL GENETICO: El material genético se compacta en un área discreta de la célula formando los cromosomas. Éstos se encuentran en los virus, células procariotas, en el núcleo de células eucariortas y en cloroplastos y mitocondrias.





La mayoría de los virus, presenta un sólo cromosoma formado por ADN o ARN que puede ser unicatenario, bicatenario, lineal o circular.



El cromosoma bacteriano se compacta formando una estructura llamada NUCLEOIDE. Es un cromosoma circular y bicatenario formado por ADN, ARN y proteínas básicas. Se produce una interacción entre el ADN cargado positivamente y las proteínas cargadas negativamente. Junto al cromosoma se pueden encontrar plásmidos.



En células eucarióticas que no se hayan sometidas a división celular el cromosoma recibe el nombre de cromatina. La cromatina consiste en fibras que contienen proteínas, ADN (en cantidades muy parecidas) y una pequeña porción de ARN. Las proteínas que se asocian al ADN son básicas y se llaman histonas. Las histonas que participan son H1, H2A, H2B, H3 y H4 y su porcentaje de aminoácidos básicos y características son:




Los cromosomas politénicos o gigantes (miden más o menos 2 mm) se descubrieron en Drosophila y se han observado en otros dípteros. Estos cromosomas tienen bandas y se producen en ciertas células secretoras que no se dividen. Este sistema de bandas está muy especializado.





OBJETIVOS
v  Comprender la forma en que esta organizado el genoma de los organismoa para entender su funcionamiento.
v  Relacionar los distintos grados de empaquetamiento con las distintas etapas del ciclo celular.
v  Discutir las distintas maneras en que el ADN se organiza en cromosomas, incluyendo virus, bacterias y eucariotas.


METODOLOGIA
La metodología que utilizare o los pasos a seguir para la publicación y desarrollo de los diferentes subtemas serán: haciendo un resumen al final de la unidad de todos los subtemas, publicando lo más importante y con toda claridad, de cada tema visto en clase. Además los trabajos que se hagan  en clase se publicaran en ese mismo día y las evaluaciones (exámenes) se publicaran al  final de la unidad, así como las tareas que deje el profesor en la fecha que indique.














lunes, 20 de febrero de 2012

INVESTIGACION SOBRE LAS DIFERENTES FORMAS DEL ADN

SEP                                               SNEST                                             DGZ

TRABAJO: INVESTIGACION SOBRE LAS FORMAS DEL ADN

PRESENTA: MARTIN HERRERA JUAREZ

No DE CONTROL: 09930312

CARRERA: LIC. EN BIOLOGIA

VI SEMESTRE

Ciudad Altamirano gro. México a 21 de febrero del 2012

RESUMEN


El ADN es la estructura mas importante para la supervivencia del ser humano, ya que gracias a ella se pueden transmitir los caracteres hereditarios de una generación a otra, esto para hacer que la nueva descendencia tenga mejores características tanto genotípicas como fenotípicas, además de que también le permiten poder manipular a diferentes organismos tanto plantas como animales para su beneficio.
El ADN se puede encontrar en diferentes formas dependiendo el organismo en que se encuentre, puede ser: de forma de ADN- A, de ADN- B, de ADN -Z y se pueden encontrar en otras mas. El modelo forma mas común es la de ADN-B la propuesta por Watson y Crick. Conocer toda esta información es interesante e importante para poder saber como se va desarrollando la vida y que sucesos van transcurriendo para que se de. A continuación se presenta en que otras formas podemos encontrar la estructura del ADN y sus principales características y cuales son las diferencias que presentan cada una.


SUMMARY
The DNA is the most important for human survival, and thanks to it can transmit hereditary characteristics from one generation to another, this to make the new offspring has better features of both genotypic and phenotypic, plus it also allow you to manipulate various agencies both plants and animals for profit.

The DNA can be found in different forms depending on the organism in which it is, can be: in the form of DNA-A,-B-DNA, Z-DNA and can be found in other more. The model is the most common form of B-DNA proposed by Watson and Crick. Knowing all this information is interesting and important to know how life unfolds and events that will elapse for the. Here is where we can find other forms of DNA structure and its main features and what are the differences that occur each.

INDICE


v  ANTECEDENTES………………………………………….1

v  DEFINICION DEL PROBLEMA……………………………….2
v  JUSTIFICACION…………………………………………………3

v  OBJETIVOS………………………………………………………..4

v  FUNDAMENTO TEORICO…………………………………………5

v  MATERIALES Y METODOS…………………………………….....6

v  RESULTADOS…………………………………………………….7

v  CONCLUCIONES…………………………………………………..8

v  RECOMENDACIONES………………………………………………9

v  FUENTES CONSULTADAS………………………………………..10

1-ANTECEDENTES
La mayoría de las personas no saben que otras formas además del modelo común que todos observamos ya sea, en laminas, en libros o algún tipo de revista, podemos encontrar la estructura del ADN. El modelo común es el propuesto por los científicos Watson y Crick en 1953, una estructura de doble hélice, helicoidal, con surco mayor y surco menor, dextrógira,  anti paralela, en donde se guarda el material genético y que se transfiere de generación en generación, pero este modelo en que se presenta las hélices del ADN, no son la única, ya que podemos encontrar otras formas de ADN, dependiendo la característica de la doble hélice, por ejemplo; el ADN-A, cuándo esta deshidratado o hibridado con el ARN, el ADN-Z, cuando su giro de las hélices es levógiro.
Los motivos para realizar este trabajo son; que la gente sepa y se dé cuenta de que existen otras formas en que podemos encontrar la molécula del ADN, dependiendo de como se encuentren las hélices de la molécula. Además de que tengan mas conocimiento sobre la estructura que permite que son sigamos desarrollando, es decir, que es lo que nos permite seguir evolucionando y que es lo que nos podría detener esa evolución.


2-DEFINICION  DEL PROBLEMA


Existen otras formas en que podemos encontrar la molécula del ADN, aparte del modelo descrito por  Watson y Crick?
Es importante conocer como esta formada la estructura del  ADN?
Que función principal desempeña la molécula del ADN?
El ADN se puede encontrar de diferentes formas, pero la mas importante a nivel biológico es la propuesta por Watson y Crick, cuyo estudio esta basado del ADN  en disolución (hidratado). Ya que es la que presenta el ADN  en interacción con las proteínas nucleares.
3-JUSTIFICACION
Este trabajo es de gran importancia, ya que beneficia a toda la gente, no es particular a nadie, es decir, no solo es para que les sirva a gente rica o de estudio, sino a toda aquella gente que le interese saber mas sobre como se desarrolla la vida. Este trabajo es importante o significativo por que en el se describe como uno puede encontrar la estructura del ADN aparte del modelo que todos sabemos o conocemos. Además como uno puede saber cual modelo es el mas importante y por que.
4-OBJETIVO


v  Conocer e identificar cuales son las diferentes formas en que se puede encontrar la molécula del ADN y cuales son sus funciones de cada una.


5-FUNDAMENTO TEORICO


El modelo de la Doble Hélice propuesto por Watson y Crick está basado en estudios del ADN en disolución (hidratado). La denominada forma B ó ADN-B tiene un mayor interés biológico ya que es la que presenta el ADN en interacción con las proteínas nucleares. Además de la forma B, existen otras estructuras posibles que puede presentar el ADN. Algunas de estas alternativas son las siguientes:
  • ADN-B: ADN en disolución, 92% de humedad relativa, se encuentra en soluciones con baja fuerza iónica se corresponde con el modelo de la Doble Hélice (ver figura 1).
  • ADN-A: ADN con 75% de humedad, requiere Na, K o Cs como contra iones, presenta 11 pares de bases por giro completo y 23 de diámetro. Es interesante por presentar una estructura parecida a la de los híbridos ADN-ARN y a las regiones de auto apareamiento ARN-ARN( ver figura 1).
  • ADN-C: ADN con 66% de humedad, se obtiene en presencia de iones Li, muestra 9+1/3 pares de bases por giro completo y 19 de diámetro(ver figura 2).
  • ADN-Z: doble hélice sinistrorsa (enrollamiento a izquierdas), 12 pares de bases por giro completo, 18 de diámetro, se observa en segmentos de ADN con secuencia alternante de bases púricas y pirimidínicas (GCGCGC), debido a la conformación alternante de los residuos azúcar-fosfato sigue un curso en zig-zag. Requiere una concentración de cationes superior a la del ADN-B, y teniendo en cuenta que las proteínas que interaccionan con el ADN tienen gran cantidad de residuos básicos sería posible que algunas convirtieran segmentos de ADN-B en ADN-Z. Las posiciones N7 y C8 de la Guanina son más accesibles(ver figura 1).
  • ADN con enrollamiento paranémico: Las dos hélices se pueden separar por traslación, cada hélice tiene segmentos alternantes dextrorsos y sinistrorsos de unas cinco bases. Uno de los principales problemas del modelo de la doble hélice (ADN-B) es el enrollamiento plectonémico, para separar las dos hélices es necesario girarlas como un sacacorchos, siendo necesario un gran aporte energético.
  • ADN triple hélice o ADN-H: "In vitro" es posible obtener tramos de triple hélice intercalando oligonucleótidos cortos constituidos solamente por pirimidinas (timinas y citosinas) en el surco mayor de una doble hélice. Este oligonucleótido se une a pares de bases A-T y G-C mediante enlaces de hidrógeno tipo Hoogsteen que se establecen entre la T o la C del oligonucleótido y los pares A-T y G-C de la doble hélice. No se sabe la función biológica del ADN-H aunque se ha detectado en cromosomas eucarióticos(ver figura 3).
  • ADN cuadruplexo: "In vitro" se han obtenido cuartetos de Guanina (ADN cuadruplexo) unidas mediante enlaces tipo Hoogsteen, empleando poli nucleótidos que solamente contienen Guanina (G). Los extremos de los cromosomas eucarióticos (telómeros) tienen una estructura especial con un extremo 3' OH de cadena sencilla (monocatenario) en el que se repite muchas veces en tándem una secuencia rica en Guaninas. Se piensa que el ADN cuadruplexo telomérico serviría para proteger los extremos cromosómicos de la degradación enzimática. Ejemplo de secuencia telomérica rica en guaninas (G): 5´P TTGGGTTGGGGTTGGGG...............TTGGGG 3'OH(ver figura 4).
  • Palíndromos: plegamiento o apareamiento de una hélice consigo misma. El palíndromo también es una figura gramatical que se lee igual en los dos sentidos, por ejemplo: DABALE ARROZ A LA ZORRA EL ABAD. Existe ADN palindrómico de hélice sencilla y de hélice doble. En el palíndromo de doble cadena la secuencia de bases se lee igual en dirección 5’ P→ 3’OH en ambas cadenas(ver figura 5). 
6-MATERIALES Y METODOS
Para realizar este trabajo se necesito, primero de tiempo, de  investigación documentada, de una computadora para poder desarrollar el tema y la investigación.

El método que se utilizo fue el método descriptivo; por que se necesito hacer una investigación  bien cuidadosa del tema tratado, se citaron diferentes fuentes, pero se eligió o escogió la que estuvo mejor detallada y mas convincente para realizar el tema, además de que se describió cada uno de los resultados obtenidos del tema tratado (formas del ADN) su función y características. También se tubo de base información proporcionada por un maestro de biología molecular del instituto tecnológico de ciudad Altamirano gro. Para poder realizar el presente trabajo. El método descriptivo tiene como función principal, describir cada una de las características del objeto de estudio y su aplicación. Por ultimo para la publicación de dicho trabajo se necesito de una pagina web, que ya se cuenta con ella, es un blog donde se publican todos los trabajos de biología molecular del instituto tecnológico de ciudad Altamirano gro.
7-RESULTADOS
Los resultados obtenidos de este trabajo fueron los siguientes:
Las otras formas en que se puede encontrar al ADN aparte del modelo común son las que se muestran en las figuras; 1, 2, 3, 4, Y 5.
                                                      FIGURA: 1
                                       ADN-A   ADN-B   ADN-Z


FIGURA: 2                                                                      FIGURA: 3
       ADN-C
                              



                                                       ADN-H


FIGURA: 4
ADN cuadruplexo
 FIGURAS: 5
 Secuencias
palindrómicas







Palíndromos en ADN
de una y doble hélice



8-CONCLUSIONES
Los resultados que se obtuvieron fueron los esperados, es decir, ya se sabía que el ADN se podía o se puede encontrar de diferentes formas, y esto se pudo comprobar con los resultados que se dieron. Esto nos muestra que el ADN  es una de loas estructuras mas importantes que todo ser vivo tiene y que sin ella no podría existir la vida, ya que en ella se encuentran diferentes moléculas que necesitan de ella para poder llevar acabo sus diferentes funciones. Gracias a este trabajo uno ya puede identificar que tipo de ADN tiene o presenta un organismo y que función desempeña, además de cual de todos estos modelos es el mas importante y por qué, también que diferencia hay entre cada uno. Este trabajo resulto todo un éxito por que se cumplió el objetivo  que era el conocer y poder identificar las diferentes formas en que se puede encontrar el ADN y que función tiene cada una.
9-RECOMENDACIONES
Con base en este trabajo se pueden realizar otros mas  a fondo, ya que este trabajo simplemente se baso en las formas en que podemos encontrar al ADN y no en el porqué de esas formas y como se descubrieron y para que pueden utilizarse en un futuro o para que se utilizan en el presente. Porque con datos obtenidos de este trabajo uno se dio cuenta de que algunos de estas formas se pueden realizar in vitro, es decir, sintéticamente uno puede manipular el ADN en su estructura pero todo esto con bases científicas y con gente capacitada, y esto nos demuestra que hay mucha mas información sobre este temo que nos podrían ayudar para trabajos posteriores, e incluso si quisiéramos hacer un proyecto sobre ADN esto nos seria de mucha ayuda, pero necesitaríamos mas información y adentrarnos ahora si punto por punto, además de que se llevaría algo de tiempo.


10-FUENTES CONSULTADAS