domingo, 5 de febrero de 2012

DESARROLLO DE LA UNIDAD


INTRODUCCION A LA BIOLOGIA MOLECULAR

El termino biología molecular fue utilizado por primera vez en 1945 por William Astbury para referirse al estudio de la estructura química y física de las macromoléculas biológicas.

DEFINICION: es la disciplina científica que tiene como objetivo el estudio de los procesos que se desarrollan en los seres vivos desde un punto de vista molecular.
DESDE EL PUNTO DE VISTA DEL PROYECTO GENOMA HUMANO: es el estudio de la estructura, función y composición de las moléculas biológicamente importantes.

La biología molecular concierne principalmente al entendimiento de las interacciones de los diferentes sistemas de la célula, lo que incluye muchísimas relaciones, entre ellas las del ADN con el ARN, la síntesis de proteínas, el metabolismo, y el cómo todas esas interacciones son reguladas para conseguir un correcto funcionamiento de la célula.

LA RELACION DE LA BIOLOGIA MOLECULAR CON OTRAS  CIENCIAS:

*    con la Genética se interesa por la estructura y funcionamiento de los genes y por la regulación (inducción y represión) de la síntesis intracelular de enzimas y de otras proteínas.
*    Con la Citología, se ocupa de la estructura de los corpúsculos subcelulares (núcleo, nucléolo, mitocondrias, ribosomas, lisosomas, etc.) y sus funciones dentro de la célula.

*    Con la Bioquímica estudia la composición y cinética de las enzimas, interesándose por los tipos de catálisis enzimática, activaciones, inhibiciones competitivas o alostéricas, etc.

*    También colabora con la Filogenética al estudiar la composición detallada de determinadas moléculas en las distintas especies de seres vivos, aportando valiosos datos para el conocimiento de la evolución.
1.1-         EL DESARROLLO DE LA BIOLOGIA MOLECULAR

1.1.1  El descubrimiento del principio transformante.

Para saber cual era el material genético, es decir, el lugar o estructura donde se encuentra toda la información hereditaria de todos los organismos vivos, se hicieron varios experimentos para poder descubrir tal acontecimiento que cambiaria la perspectiva del mundo. Y fue haci como empezó el estudio de la biología molecular.

EXPERIMENTOS
    EXPERIMENTO DE GRIFFITH (1928)

 
      


 
En 1928 en el transcurso de sus experimentos con la bacteria Streptococcus pneumoniae, Frederick Griffith había hecho una misteriosa observación. Griffith utilizo en sus experimentos dos cepas que se distingan por la apariencia de las colonias crecidas en laboratorio. Las células de una de las cepas, de tipo virulento normal, están rodeadas por una cápsula de polisacáridos que le da a la colonia apariencia lisa(S). Las células de la otra cepa (un tipo mutante) no virulento que se reproduce en los ratones pero no es letal, carecen de esta cápsula de polisacáridos, lo cual hace que las colonias tengan apariencia rugosa(R).

·        Primero griffith inyecto a ratones células vivas de la bacteria de tipo letal(s) y murieron los ratones.

·        Después inyecto otros ratones con la otra cepa de células vivas no letales(r)y los ratones no se murieron.

·        Después mato algunas células virulentas poniéndolas a hervir y después inyecto las células muertas a los ratones pero estos no se murieron.

·        Después lo que hizo fue mezclar células no virulentas vivas y células virulentas muertas a los ratones y lo que obtuvo fueron la mayoría de ratones muertos y solo pocos vivos. De alguna manera las células virulentas muertas al calor debieron haber transformado las células vivas no virulentas en letales, a este proceso se le denomina transformación.

 

RESUMEN: Los experimentos de Griffith demostraron que la transformación ocurría por la absorción por parte de células vivas (estirpe R) de un “principio transformante” que se encontraba en las células muertas (Estirpe S). Ese principio transformante tenia la característica de producir una cápsula de polisacáridos (se expresaba) y producía además la muerte en ratones, en otras palabras estaban confiriendo propiedades hereditarias a la célula recipiente, ese principio transformante se sabría después que eran moléculas de DNA.

· EXPERIMENTOS DE AVERY Y COLABORADORES (1944)


Estos científicos se basaron en el mismo experimento de grifith para explicar lo mismo, pero lo que ellos hicieron fue separar todos los componentes de la célula de tipo virulento (s) muertas por calor y estudiaron su capacidad transformante por separado.

 

 
Estas pruebas demostraron, en primer lugar, que los propios polisacáridos no trasformaban a las células rugosas. Por tanto la cubierta de polisacáridos, aunque claramente implicada en la acción patogénica, es solo la expresión fenotípica de la virulencia. Tras el escrutinio de los diferentes compuestos (Polisacáridos, Lípidos, RNA, Proteínas y DNA), Avery y col. Descubrieron que solo DNA, inducía la transformación de las células R, dedujeron que el DNA es el agente que determina la aparición del polisacárido y, por tanto, del carácter patogénico. Es mas, parece ser que proveer  a las células R del DNA de las células S es equivalente a ¡proveerlas de los genes de las células S!!

 
·        EXPERIMENTOS DE HERSEY Y CHASE (1952)

 


Para determinar por completo y para que toda la gente aceptara que el ADN es donde se guarda todo el material genético y no en las proteínas se hizo un ultimo experimento, el cual lo llevaron acabo los científicos Alfred Hersey y Martha Chase en 1952, utilizando un fago(T2 ).


La mayor parte de la estructura de un fago es proteína, estando el DNA en el interior de la envuelta proteica o “cabeza”. En las proteínas no se encuentra fósforo, que si forma parte del DNA; inversamente, el azufre esta presente en las proteínas pero nunca en el DNA.

PROCEDIMIENTO:

Ø Hersey y Chase marcaron el DNA del fago con un radioisótopo del fósforo (P32)  y las proteínas con azufre (S35), en cultivos distintos de fagos. Usaron entonces cada cultivo por separado, para infectar E. coli con muchas partículas de virus por cada célula.

Ø Tras dejar tiempo suficiente para que se produjera la infección, separaron de las células bacterianas las carcasas vacías de los fagos llamadas “fantasmas” mediante agitación con una batidora de cocina.

Ø Separaron las células bacterianas de los fantasmas de los fagos, mediante centrifugación, y midieron entonces la radioactividad en las dos fracciones. Cuando se usaron los fagos con P32, la mayor parte de la radioactividad terminaba en las células bacterianas, indicando que el DNA viral entraba en las células.

Ø Cuando se usaron los fagos marcados con S35, la mayor parte de la radiactividad terminaba en los fantasmas virales, indicando que la proteína viral nunca entra en la célula bacteriana.


CONCLUSION: El DNA es el material hereditario; las proteínas fágicas son meros empaquetadores estructurales que se desechan después de inyectar el vital  DNA en la célula bacteriana. Demostraron que el DNA es donde se guarda toda la información genética hereditaria y que en las proteínas no, terminando así con la gran controversia de esa época y aceptando todos el ADN como esa estructura.
1.1.2 El descubrimiento de la estructura del ADN.
Después de que el papel central del DNA en la herencia se hizo evidente, muchos científicos se dispusieron a determinar su estructura con exactitud.
Los primeros que tuvieron éxito en descubrir la estructura fueron Watson y Crick en 1953- tuvieron en cuenta dos tipos de pistas.
v Rosalind Franklin y Maurice Wilkins, habían acumulado muchos datos de difracción de rayos X sobre la estructura de DNA.
v El segundo tipo de datos procedía del trabajo de años antes de Edwin Chargaff. Estudio DNA de diferentes organismos, Chargaff estableció ciertas reglas empíricas sobre las cantidades de cada componente del DNA:


Erwin Chargaff analizó la composición de bases de distintos organismos y encontró distintas proporciones de los 4 nucleótidos en cada uno de los organismos estudiados. También observó que esta composición no cambiaba con la edad ni el ambiente. Pero lo más importante es que había tantas purinas como pirimidinas en todos los organismos.
 


 Las reglas de Chargaff son:
1.   la cantidad total de nucleótidos pirimidinicos (T + C) es siempre igual a la cantidad total de nucleótidos púricos (A + G).
2.   la cantidad de T es siempre igual a la de A y la cantidad de C es siempre igual a la de G. pero A + T no necesariamente es igual a C+G

En los primeros análisis de difracción de R-X realizados por Rosalyn Franklin se observaba que el DNA tenía un espaciado regular de 0,34 nm. Éste y otros indicios indicaban que debe tener algún tipo de estructura en hélice que se repite periódicamente, los datos sugerían que el DNA era largo y fino y que consta de dos partes separadas que corre una al lado de la otra a lo largo de la molécula, también demostraba que la molécula era helicoidal.

Watson y Crick construyeron un modelo que cumpliera todas las investigaciones que sobre el DNA se habían realizado hasta la fecha y propusieron, además, cómo tenía que conservarse y transmitirse la información de esta molécula. También introdujeron que esta molécula se podía mutagenizar espontáneamente mediante la tautomería.


1.1.1  El descubrimiento del código genético.
Desde que se demostró que las proteínas eran producto de los genes, y que cada gen estaba formado por fracciones de cadenas de ADN, los científicos llegaron a la conclusión de que debe haber un código genético mediante el cual el orden de las cuatro bases nitrogenadas en el ADN podría determinar la secuencia de aminoácidos en la formación de polipéptidos. La estructura tridimensional de la molécula de ADN fue demostrada por James D. Watson y Francis Crick en 1953. Pero faltaba averiguar cómo interpreta el organismo la secuencia de las distintas bases que forman la estructura lineal del ADN para sintetizar las cadenas de aminoácidos de las proteínas. La solución a este enigma, el código genético, se halló en 1966 gracias a la colaboración entre numerosos investigadores, entre ellos Marshall Núremberg.


Su solución dependió en gran medida de las investigaciones llevadas a cabo sobre otro grupo de ácidos nucleicos, los ácidos ribonucleicos (ARN). Se observó que la obtención de un polipéptido a partir del ADN se producía de forma indirecta a través de una molécula intermedia conocida como ARN mensajero (ARNm).
El código genético asocia a cada triplete de bases del ADN, llamado codón, un aminoácido concreto. Con los cuatro tipos de bases (U, uracilo; A, adenina; G, guanina; y C, citosina) que forman la molécula de ARN, sintetizada de manera complementaria a partir de la de ADN, se pueden formar 64 tripletes distintos (por ejemplo, UAC, UGG y AUC, entre otros). Cada codón se atribuye a un aminoácido concreto de los veinte posibles sin ninguna ambigüedad.
El primer paso para el desciframiento fue el descubrimiento de cómo fabricar RNAm sintético. Si los nucleótidos que conforman el RNA se mezclan con una enzima especial (fosforilasa de los polinucleotidos) se forma una cadena sencilla de RNA de la reacción. Esta síntesis no requiere ADN y los nucleotidos se incorporan al azar. La capacidad de sintetizar RNA habría la posibilidad de crear secuencias especificas de ARN y comprobar que aminoácidos se incorporaban al utilizarlas como RNAm.
El primer mensajero sintético obtenido, Poli(U), se fabrico mezclando solo nucleótidos de U, produciendo así –UUUUUUUU-.
En 1961 Marshall Núremberg y Heinrich Mathaei mezclaron in vitro Poli (u) y la maquina sintetizadora de proteínas de E. coli (Ribosomas, RNAt, energía, varias enzimas y algunas cosas mas) y observaron la formación de una proteína!! Resultando como secuencia de proteína ser una ristra de Fenilalanina. Así pues, el triplete UUU debe ser el codón de fenilalanina.
                                                          

                                                      UUU   UUU   UUU   UUU
                                                          I           I          I          I
                                                       - Phe   -  Phe   -  Phe  -Phe -
 
Este tipo de análisis se amplio mezclando diferentes tipos de nucleótidos, en proporciones fijas conocidas. En un experimento los nucleótidos Uracilo y Guanina se mezclaron en razón 3:1. al incorporase los nucleótidos al azar en el RNAm sintético, la frecuencia relativa con la que aparece. hacia 1966 con Severo Ochoa ya se había descifrado los codones de los 20 aminoácidos.
1.1       LA BIOLOGÍA MOLECULAR EN MÉXICO.

VENTAJAS:

*    Existe en México una gran institución que aporta recursos para llevar acabo investigaciones(CONACYT).
*    En México existen instituciones que aceptan donativos de fundaciones privadas de otros países, para llevar acabo las investigaciones(E.U).
*    De acuerdo a las investigaciones que se han hecho, se ha logrado salvar vidas, como los trasplantes de páncreas en Acapulco gro(órganos de animales a humanos).
*    Gracias a investigadores mexicanos que estuvieron en el extranjero realizando trabajos de investigación lograron formar una gran institución de investigación, que ahora es una de las mejores instituciones a nivel nacional e internacional(CINVESTAV).
*    Gracias a las instituciones que se han formado, brindan la posibilidad de que estudiantes se titulen, hagan posgrados, doctorados y que publiquen sus artículos de investigación en fuentes reconocidas.
*    Gracias a las plantas transgénicas que se han logrado desarrollar en estos centros de investigación, se han generado muchos recursos económicos y han contribuido a la ciencia muy positivamente.

DESVENTAJAS:

*    No es una carrera bien pagada en mexico

*    Mexico no invierte casi nada en investigaciones cientificas

*    No hay apoyo a todas las instituciones que existen en el pais, solo lo acen con unas pocas y a esas les dan grandes inversiones de dinero y dejan como consecuencia a las otras aun lado, provocando que se vallan retirando poco a poco de proyectos de investigacion cientifica.

*    En mexico, no hay apoyo a los cientificos investigadores  de mayor edad al retirarse y por eso casi nadie quiere serlo y prefiere otra carrera que si lo haga y que paguen mas, aunque sea poco reconocida.

*    No hay o no invierten en infracestructura para nuevos centros de investigacion, con tecnologia de punta.

*    A los estudiantes no los apoyan economicamente con becas para que puedan terminar su carrera, ya que la mayoria de las carreras que tienen que ver con estas investigaciones, son muy caras de estudiarlas.

1.3      Perspectivas futuras de la Biología Molecular.
Después de que los científicos lograron identificar el ADN como la molécula que contiene la mayoría, si no toda, de la información genética de una célula el mero campo de la genética molecular avanzo rápidamente a finales de la década de los años 50 y principios de los años 60 proporcionado nuevos conceptos a una velocidad que solo puede compararse con la del desarrollo de la mecánica cuántica de los años 20. el éxito inicial y la acumulación  de una gran cantidad de información permitieron a los investigadores aplicar las técnicas y los modernos métodos biológicos de la genética molecular.

Las aplicaciones de la biología molecular y campo de estudio

·        Estudios en investigación molecular básica y aplicada:
·        Clonación genética e hibridación
·        Tecnología del ADN Recombinante o ingeniería genética (organismos transgénicos)
·        Reacción en Cadena de la Polimerasa (RCP)
·        Aislamiento de DNA y RNA (Southern y Northern)
·        La tecnología denominada huella de ADN (DNA fingerprinting)
·        Procedimiento denominado secuenciación de ADN
·        Terapia génica
·        Genes interrumpidos (Knock out)
·        Control de la expresión génica
·        Terapia germinal (células madres)
·        Creación de genotecas (bibliotecas de ADN)
·        Taxonomía genética y evolucionismo
·        Otros.



La investigación sobre el ADN tiene un impacto significativo, especialmente en el ámbito de la medicina. A través de la tecnología del ADN recombinante los científicos pueden modificar microrganismos que llegan a convertir en auténticas fábricas para producir grandes cantidades de sustancias útiles. Por ejemplo, esta técnica se ha empleado para producir insulina (necesaria para los enfermos de diabetes) o interferón (muy útil en el tratamiento del cáncer). Los estudios sobre el ADN humano también revelan la existencia de genes asociados con enfermedades específicas como la fibrosis quística y determinados tipos de cáncer. Esta información puede ser valiosa para el diagnóstico preventivo de varios tipos de enfermedades.
 

La medicina forense utiliza técnicas desarrolladas en el curso de la investigación sobre el ADN para identificar delincuentes. Las muestras de ADN tomadas de semen, piel o sangre en el escenario del crimen se comparan con el ADN del sospechoso; el resultado es una prueba que puede utilizarse ante los tribunales..                 

HUELLA  DE ADN



BIBLIOGRAFIA:

·        Wikipedia/imágenes/.com












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